Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf235Q61116 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf235Q61116 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf235Q61116 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms