Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prdm6Q3UZD5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms