Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Psme1P97371 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms