Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnga1P29974 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.7 ms