Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb3P09026 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb3P09026 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms