Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BsnO88737 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BsnO88737 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BsnO88737 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BsnO88737 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
BsnO88737 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BsnO88737 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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BsnO88737 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BsnO88737 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BsnO88737 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BsnO88737 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BsnO88737 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BsnO88737 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BsnO88737 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BsnO88737 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BsnO88737 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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