Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2f6O54917 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2f6O54917 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms