Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd4b4J3QNS5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms