Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Catsperg2C6KI89 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsperg2C6KI89 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms