Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms