Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1bp2Q9R000 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1bp2Q9R000 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms