Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc1Q9QZF2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms