Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rsph3bQ9DA80 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rsph3bQ9DA80 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms