Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gps1Q99LD4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms