Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Knl1Q66JQ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Knl1Q66JQ7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms