Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Foxd1Q61345 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Foxd1Q61345 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms