Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Pacs2Q3V3Q7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Pacs2Q3V3Q7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Pacs2Q3V3Q7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Pacs2Q3V3Q7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Pacs2Q3V3Q7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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Pacs2Q3V3Q7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms