Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Prdm6Q3UZD5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Prdm6Q3UZD5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Prdm6Q3UZD5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Prdm6Q3UZD5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Prdm6Q3UZD5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Prdm6Q3UZD5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Prdm6Q3UZD5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Prdm6Q3UZD5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm6Q3UZD5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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