Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psme1P97371 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psme1P97371 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psme1P97371 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms