Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Rnft1Q9DCN7 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rnft1Q9DCN7 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rnft1Q9DCN7 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rnft1Q9DCN7 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rnft1Q9DCN7 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Rnft1Q9DCN7 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Rnft1Q9DCN7 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rnft1Q9DCN7 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Rnft1Q9DCN7 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Rnft1Q9DCN7 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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Rnft1Q9DCN7 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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Rnft1Q9DCN7 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rnft1Q9DCN7 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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