Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Prrt1O35449 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Prrt1O35449 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Prrt1O35449 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Prrt1O35449 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Prrt1O35449 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Prrt1O35449 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Prrt1O35449 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Prrt1O35449 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Prrt1O35449 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Prrt1O35449 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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