Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col5a3Q9JLI2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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