Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a3Q9DC26 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1466.2 ms