Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms