Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc8Q9CYA6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms