Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gps1Q99LD4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms