Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot1Q6ZQ08 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms