Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Prdm6Q3UZD5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Prdm6Q3UZD5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Prdm6Q3UZD5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Prdm6Q3UZD5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm6Q3UZD5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms