Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms