Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brf2Q3UAW9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brf2Q3UAW9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms