Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RhoP15409 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RhoP15409 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RhoP15409 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RhoP15409 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RhoP15409 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RhoP15409 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RhoP15409 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RhoP15409 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms