Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mfsd4b4J3QNS5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms