Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms