Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Speer4aF8VPX6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Speer4aF8VPX6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 707.9 ms