Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc8E9PWG2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms