Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdc27A2A6Q5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdc27A2A6Q5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms