Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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