Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col5a3Q9JLI2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col5a3Q9JLI2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms