Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AatfQ9JKX4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AatfQ9JKX4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms