Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms