Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lactb2Q99KR3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lactb2Q99KR3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 308.9 ms