Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2surpQ6NV83 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2surpQ6NV83 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms