Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdc1Q5PSV9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms