Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kif3aP28741 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3aP28741 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms