Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RhoP15409 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RhoP15409 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RhoP15409 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhoP15409 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhoP15409 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RhoP15409 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhoP15409 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhoP15409 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhoP15409 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhoP15409 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhoP15409 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhoP15409 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RhoP15409 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhoP15409 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhoP15409 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhoP15409 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhoP15409 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhoP15409 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhoP15409 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhoP15409 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhoP15409 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RhoP15409 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RhoP15409 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RhoP15409 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms