Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb3P09026 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb3P09026 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms