Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms