Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pde4bB1AWC9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde4bB1AWC9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms