Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubl3Q9Z2M6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubl3Q9Z2M6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms