Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc1Q9QZF2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc1Q9QZF2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Gpc1Q9QZF2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Gpc1Q9QZF2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Gpc1Q9QZF2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpc1Q9QZF2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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